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ATAC-Seq試劑盒
在全基因組范圍內分析開放的染色質區域。
ATAC-Seq試劑盒總覽
ATAC-Seq是一種快速檢測方法,可通過識別具有開放或可及狀態的染色質區域來分析整個基因組的表觀遺傳概況。ATAC-Seq方法快速,簡便,適用于廣泛的樣品類型,已成為常用的表觀遺傳學分析方法,并且可以作為更深入的表觀遺傳學分析的基礎。
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在ATAC-Seq實驗中,用高活性的突變Tn5轉座酶處理來自細胞或組織樣品的完整細胞核。該轉座酶把DNA片段化的同時用測序接頭標記靶DNA。
Active Motif的ATAC-Seq試劑盒提供了與Illumina®平臺兼容的ATAC-Seq文庫制備試劑,可以從20 – 30 mg組織或50,000 – 100,000個細胞中生成16種不同的ATAC-Seq文庫。經過優化的方案將指導您完成樣品制備、DNA片段標記和文庫構建的步驟,構建可在單個測序反應中進行多重測序的文庫。
ATAC-Seq試劑盒亮點
顯示開放染色質區域的基因組序列
僅需數小時即可完成NGS文庫制備
簡單,快速的實驗步驟與優化的試劑
ATAC-Seq試劑盒數據
ATAC-Seq試劑盒包含進行16個ATAC-Seq反應所需的試劑和酶。這些試劑盒組分經過優化,可以高效工作,經驗證可以生成高質量的ATAC-Seq數據。
揭示啟動子處染色質的開放位置
具有轉錄活性的基因,其啟動子處的染色質通常是開放的或可及的。ATAC-Seq分析會在這些位置產生峰,揭示正在研究的樣品中開放的染色質區域。
圖1:ATAC-Seq試劑盒實驗結果展示在基因組瀏覽器中。ATAC-Seq試劑盒用于評估小鼠腦組織樣品的全基因組開放染色質狀態。此處顯示的基因組瀏覽器軌跡位于FOXP3基因位置,該基因編碼有絲分裂后神經元的生物標記物。峰表明在FOXP3基因的啟動子上有開放的染色質。
試劑盒實驗結果與已發表數據高度相關
Active Motif的ATAC-Seq試劑盒可生成高質量數據。使用ATAC-Seq試劑盒產生的ATAC-Seq數據與已發表的ATAC-Seq數據具有很好的相關性,這突出說明了該檢測方法的可靠性和可重復性。
ATAC-Seq試劑盒組分
ATAC-Seq試劑盒包含兩盒組分,其中-20°C保存的一盒組分干冰運輸,4°C保存的另一盒組分室溫運輸。使用后,請根據說明書中的存放條件保存。妥善保管的試劑自收貨之日起可穩定保存6個月。
試劑包括
ATAC Lysis Buffer, store at RT
Assembled Transposomes, store at -20°C
2X Tagmentation Buffer, store at -20°C
1X PBS, store at -20°C or RT
10X PBS, store at RT
10% Tween 20, store at RT
0.5% Digitonin, store at RT
DNA Purification Columns, store at RT
DNA Purification Binding Buffer, store at RT
DNA Purification Wash Buffer, store at RT
DNA Purification Elution Buffer, store at RT
3 M Sodium Acetate, store at RT
10 mM dNTPs, store at -20°C
5X Q5 Buffer, store at -20°C
Q5 High-Fidelity DNA Polymerase, store at -20°C
i7 Indexed Primer 1, store at -20°C
i7 Indexed Primer 2, store at -20°C
i7 Indexed Primer 3, store at -20°C
i7 Indexed Primer 4, store at -20°C
i5 Indexed Primer 1, store at -20°C
i5 Indexed Primer 2, store at -20°C
i5 Indexed Primer 3, store at -20°C
i5 Indexed Primer 4, store at -20°C
SPRI Beads, store at 4°C
單細胞ATAC-Seq(scATAC-Seq)技術服務
單細胞水平識別染色質開放區域一站式技術服務
scATAC-Seq 簡介
單細胞ATAC-Seq(scATAC)基于轉座酶介導的測序引物插入開放的染色質區域。像普通的ATAC-Seq一樣,該測定法提供了染色質開放和可及區域的輪廓,這些輪廓指示了單細胞分辨率下的活躍調控區域。
我們的scATAC-Seq服務可以同時檢測數千個細胞的全基因組染色質可及性,從而可以檢測異種群體中的細胞亞群,這種細胞亞群的信息會在普通ATAC-Seq中丟失。
了解更多關于ATAC-Seq的信息
使用scATAC-Seq有什么優勢?
scATAC-Seq可用于鑒定復雜樣品中具有不同染色質可及性譜的細胞亞群,從而無需諸如FACS或磁珠分選等分離策略,這些策略可能會由于樣品處理而改變細胞生物學特性。例如:
識別腫瘤樣本中的癌癥干細胞或浸潤性巨噬細胞
識別負責藥物治療反應的新型細胞亞群(如:反應者vs.耐藥細胞)
鑒定染色質可及性變化的細胞亞群,可以洞察發育軌跡(如:大腦發育,輔助T細胞發育,B細胞分化)
北京華新康信生物科技有限公司代理ActiveMotif品牌。北京華新康信生物科技有限公司是 ActiveMotif品牌代理商。
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組蛋白和組蛋白修飾抗體
用于檢測組蛋白和修飾組蛋白的抗體
由于組蛋白對基因組DNA的組織關重要,因此組蛋白的翻譯后修飾是基因組功能的重要調節劑。組蛋白修飾參與轉錄的調控,并在維持活性和非活性染色質的離散區域中起作用。Active Motif正在為所有廣泛研究的和生物學相關的修飾位點開發一組抗體。我們嚴格篩選所有抗體的特異性,并進行測試以驗證它們在哪些應用中效果良好,例如染色質免疫沉淀(ChIP),蛋白質印跡和免疫熒光。
下表中的抗體針對組蛋白或修飾的組蛋白。單擊抗體名稱以查看其完整信息。要使用各種特定的搜索條件查找要尋找的抗體,請使用“搜索”框和/或在左欄中應用各種“過濾器”。或者,您可以通過從右上角的“可用產品”下的列表中選擇,查看按不同組查看的抗體。