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ATAC-Seq Kit常見問題
1、此試劑是否和Buenrostro et al在nature上發表的方法一樣?
Active motif 基于最初Buenrostro 的文章和2017年Corces et al. 在nature上發表的文章,優化了緩沖液以滿足跟多的實驗需求和高效的實驗過程。
2、試劑盒中包含的重組Tn5酶的來源是?
此試劑盒中的Tn5是由我司克隆,表達,純化,驗證的超活性突變克隆。所提供的這款轉座酶預先已鏈接好用于NGS測序的接頭(adaptor)序列,所以它不許任何預處理過程,可直接用于實驗。
3、每個反應需要使用的小的細胞數量或者組織量是多少?
50,000個細胞或20 mg組織樣本。
4、可以使用凍存的組織和細胞嗎?
可以,但樣本得保證高質量且高活性,細胞應在控制速率冷凍中冷凍保存(例如細胞凍存液梯度凍存),冷凍介質的配方應防止冰晶形成和隨后的細胞損傷,組織應在-80°C下快速冷凍。
5、可將細胞核凍存后用于后續ATAC-seq實驗嗎?
可以的,提取的細胞核可以-80℃凍存用于后續使用。制備的同樣品細胞核可合并在一起增加樣本量。
6、可以使用FACS分選后的細胞嗎?
可能可以。但FACS后細胞可能會被破壞。一個高質量的ATAC-seq 文庫需要高質量高活性的細胞。
7、您是否建議使用40微米篩孔的細胞樣本過濾器?
是的,我們推薦使用Falcon 40微米過濾器(Falcon貨號:352340)。
8、所有樣本都需要DNase處理嗎?
DNase的處理能夠幫助確定懸液中游離DNA的去除,如線粒體DNA的去除,如果細胞樣本中有15%的死亡率,細胞活性不夠且必須使用此酶,它最終可能會移除你想要的細胞數據。只有當細胞是活較高時,并且不會被酶消化時,才建議將其作為一種選擇。
9、若沒有thermomixer,是否還能使用此試劑盒?
建議使用Thermomixer。然而,我們已經對此進行了測試,在37°C溫度下不使用thermomixer而是在帶熱蓋的熱循環器中進行轉座反應,反應能夠成功。
10、 是否能夠室溫融化此試劑盒包含的所有試劑盒組分,如master mixes和酶?
除了轉座酶和Q5 DNA polymerase 以外,其他試劑均可室溫融凍。轉座酶和Q5 DNA polymerase 包裝中含有甘油,不會被凍結,請直接放在冰上使用。其他組分可融凍多次用于以后使用,所以不需要一次性將16次的試劑用完。
11、 每個樣本需要測序多少量的reads?
常規20 M reads的測序量就足夠了。
北京華新康信也有Activemotif實驗試劑銷售,下面給大家講講Activemotif服務以及實驗樣本;Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin Activemotif實驗 Activemotif試劑 Activemotif說明 Activemotif試劑方案Activemotif實驗說明 Activemotif說明書 Activemotif技術參數 Activemotif方案對比 Activemotif介紹 Activemotif廣州試劑 Activemotif深圳試劑Activemotif說明書 Activemotif技術參數Activemotif實驗方案Activemotif技術對比Activemotif購買說明 Activemotif江蘇試劑 Activemotif北京試劑Activemotif廈門試劑Activemotif大理試劑Activemotif武漢試劑Activemotif福建試劑Activemotif安徽試劑Activemotif廣西試劑Activemotif廈門試劑Activemotif常州試劑Activemotif安徽試劑Activemotif長沙試劑Activemotif哈爾濱試劑Activemotif沈陽試劑Activemotif深圳試劑Activemotif武昌試劑Activemotif湖北試劑Activemotif湖南試劑Activemotif上海試劑Activemotif ForteBio實驗試劑,moltox實驗試劑,toxin實驗試劑,ForteBio moltox toxin 各種試劑的實驗參數,說明書,歡迎咨詢 Activemotif試劑介紹 Activemotif試劑介紹 Activemotif研究方案
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